Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms