Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCR1P46094 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XCR1P46094 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCR1P46094 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms