Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RANGAP1P46060 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms