Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCCP43146 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DCCP43146 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCCP43146 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCCP43146 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCCP43146 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCCP43146 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCCP43146 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCCP43146 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCCP43146 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCCP43146 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCCP43146 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCCP43146 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCCP43146 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCCP43146 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCCP43146 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms