Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTGIRP43119 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms