Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF9P41273 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms