Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms