Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSSP25774 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms