Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA1P23193 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms