Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DOBP13765 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms