Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA4P13612 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms