Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD8P13378 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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