Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHGAP10645 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHGAP10645 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms