Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAK2O60296 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms