Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP9BO43861 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms