Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM6AO15550 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM6AO15550 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms