Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CEP290O15078 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CEP290O15078 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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