Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRT4C9JH25 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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