Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms