Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms