Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEMP2A6NFY4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms