Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSRAQ9UJ68 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSRAQ9UJ68 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSRAQ9UJ68 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms