Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
FANCD2Q9BXW9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
FANCD2Q9BXW9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
FANCD2Q9BXW9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
FANCD2Q9BXW9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
FANCD2Q9BXW9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms