Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM109Q9BVC6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM109Q9BVC6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM109Q9BVC6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM109Q9BVC6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms