Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF8Q9BRL6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF8Q9BRL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF8Q9BRL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF8Q9BRL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF8Q9BRL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF8Q9BRL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF8Q9BRL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF8Q9BRL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF8Q9BRL6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms