Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL1Q99990 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL1Q99990 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL1Q99990 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VGLL1Q99990 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms