Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGREF1Q99674 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGREF1Q99674 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms