Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH12Q96NR8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDH12Q96NR8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms