Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEC22AQ96IW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 443.9 ms