Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNF8Q96H20 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNF8Q96H20 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNF8Q96H20 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms