Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL29Q96CT2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL29Q96CT2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL29Q96CT2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms