Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
NEO1Q92859 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NEO1Q92859 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NEO1Q92859 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NEO1Q92859 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
NEO1Q92859 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms