Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
1700010I14RikQ7TPG0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
1700010I14RikQ7TPG0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
1700010I14RikQ7TPG0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700010I14RikQ7TPG0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms