Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP43Q70EL4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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