Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EMBQ6PCB8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMBQ6PCB8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMBQ6PCB8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMBQ6PCB8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms