Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RGMBQ6NW40 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGMBQ6NW40 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGMBQ6NW40 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms