Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UFSP1Q6NVU6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UFSP1Q6NVU6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms