Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CLQ60I27 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALS2CLQ60I27 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms