Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL12Q53G59 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL12Q53G59 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms