Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIN52Q52LA3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN52Q52LA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms