Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM1Q15629 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM1Q15629 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM1Q15629 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms