Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF6Q15052 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ARHGEF6Q15052 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF6Q15052 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms