Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3AQ14563 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA3AQ14563 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3AQ14563 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3AQ14563 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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