Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD4Q13485 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMAD4Q13485 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD4Q13485 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD4Q13485 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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