Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 MRPS16YPL013C 366 nt7.34□□□□□ -1.23
CTI6Q08923 TPO3YPR156C 1869 nt7.33□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 PNP1YLR209C 936 nt7.33□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 CLN1YMR199W 1641 nt7.33□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 PYK2YOR347C 1521 nt7.32□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 QCR6YFR033C 444 nt7.32□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 SYN8YAL014C 768 nt7.32□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 LCB3YJL134W 1230 nt7.32□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 AAD15YOL165C 432 nt7.32□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 RRS1YOR294W 612 nt7.32□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 CIR2YOR356W 1896 nt7.32□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 PRY3YJL078C 2646 nt7.31□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 NHA1YLR138W 2958 nt7.31□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 LDB18YLL049W 540 nt7.31□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 ERI1YPL096C-A 207 nt7.31□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 PYC2YBR218C 3543 nt7.31□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 GEF1YJR040W 2340 nt7.3□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt7.3□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 YGR022CYGR022C 330 nt7.29□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 SKG1YKR100C 1068 nt7.29□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 AVT4YNL101W 2142 nt7.29□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 KTR1YOR099W 1182 nt7.29□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 YMC1YPR058W 924 nt7.29□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 YEL068CYEL068C 333 nt7.28□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 YFL064CYFL064C 525 nt7.28□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 VMA16YHR026W 642 nt7.28□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 CCP1YKR066C 1086 nt7.28□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 YPR202WYPR202W 717 nt7.28□□□□□ -1.24
CTI6Q08923 MDH3YDL078C 1032 nt7.27□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 YKR032WYKR032W 315 nt7.27□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 ARG1YOL058W 1263 nt7.27□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 SES1YDR023W 1389 nt7.27□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 YCK1YHR135C 1617 nt7.27□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 DCN1YLR128W 810 nt7.26□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 RKI1YOR095C 777 nt7.26□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 YTH1YPR107C 627 nt7.26□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 UTR2YEL040W 1404 nt7.26□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 PHO3YBR092C 1404 nt7.26□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 SGV1YPR161C 1974 nt7.26□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 EXG1YLR300W 1347 nt7.26□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 WHI2YOR043W 1461 nt7.25□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 FPR2YDR519W 408 nt7.25□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 UBC11YOR339C 471 nt7.25□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 RAD24YER173W 1980 nt7.25□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 AFG1YEL052W 1530 nt7.24□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 TMT1YER175C 900 nt7.24□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 QCR8YJL166W 285 nt7.24□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 YLR123CYLR123C 330 nt7.24□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 IME2YJL106W 1938 nt7.23□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 YLR194CYLR194C 765 nt7.23□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 TSA1YML028W 591 nt7.23□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 AGP2YBR132C 1791 nt7.23□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 ARP2YDL029W 1176 nt7.22□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.22□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 MLC1YGL106W 450 nt7.22□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 LST8YNL006W 912 nt7.22□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 YPR114WYPR114W 948 nt7.22□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 ARR3YPR201W 1215 nt7.22□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 VTS1YOR359W 1572 nt7.21□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 CCC2YDR270W 3015 nt7.21□□□□□ -1.25
CTI6Q08923 YDL057WYDL057W 987 nt7.21□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 SFC1YJR095W 969 nt7.21□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 POP5YAL033W 522 nt7.21□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 RMA1YKL132C 1293 nt7.21□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 IES2YNL215W 963 nt7.21□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 YTP1YNL237W 1380 nt7.2□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 KDX1YKL161C 1302 nt7.2□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 STF1YDL130W-A 261 nt7.19□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 SPT3YDR392W 1014 nt7.19□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 YKL031WYKL031W 414 nt7.19□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 CAR1YPL111W 1002 nt7.19□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 ERG12YMR208W 1332 nt7.19□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 CRP1YHR146W 1398 nt7.19□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 TEA1YOR337W 2280 nt7.18□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 ADE13YLR359W 1449 nt7.18□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt7.18□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 DPH5YLR172C 903 nt7.18□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 YOR300WYOR300W 309 nt7.18□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 PFK2YMR205C 2880 nt7.18□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 CNE1YAL058W 1509 nt7.17□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt7.17□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 HSP26YBR072W 645 nt7.17□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 GTT3YEL017W 1014 nt7.16□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 YUR1YJL139C 1287 nt7.16□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 YBR144CYBR144C 315 nt7.16□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 YCL041CYCL041C 495 nt7.16□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 SKI2YLR398C 3864 nt7.15□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 HRQ1YDR291W 3234 nt7.15□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 RAP1YNL216W 2484 nt7.15□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 KNH1YDL049C 807 nt7.15□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 ERG3YLR056W 1098 nt7.15□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 PUS5YLR165C 765 nt7.15□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 HAP3YBL021C 435 nt7.15□□□□□ -1.26
CTI6Q08923 HSM3YBR272C 1443 nt7.15□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 YMR155WYMR155W 1644 nt7.15□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 MAK32YCR019W 1092 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 ISC1YER019W 1434 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 PHB1YGR132C 864 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.14□□□□□ -1.27
CTI6Q08923 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms