Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 SAC6YDR129C 1929 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 FRS2YFL022C 1512 nt5.64□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 MCM6YGL201C 3054 nt5.63□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 HSP150YJL159W 1242 nt5.63□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 PSR2YLR019W 1194 nt5.63□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 QNS1YHR074W 2145 nt5.63□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 WHI2YOR043W 1461 nt5.63□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 CHO1YER026C 831 nt5.62□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 YJR084WYJR084W 1272 nt5.62□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 TAL1YLR354C 1008 nt5.62□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 TAF9YMR236W 474 nt5.62□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 MCP1YOR228C 909 nt5.62□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 HST3YOR025W 1344 nt5.62□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 NSE5YML023C 1671 nt5.62□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 DUG1YFR044C 1446 nt5.61□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 URA1YKL216W 945 nt5.61□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 MSS1YMR023C 1581 nt5.61□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 GUA1YMR217W 1578 nt5.6□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 GPD2YOL059W 1323 nt5.6□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 YJR154WYJR154W 1041 nt5.6□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 COS10YNR075W 1125 nt5.6□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 FSF1YOR271C 984 nt5.6□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 TEL2YGR099W 2067 nt5.6□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 TNA1YGR260W 1605 nt5.59□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 XBP1YIL101C 1944 nt5.59□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 OM45YIL136W 1182 nt5.59□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 MHT1YLL062C 975 nt5.59□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 YHM2YMR241W 945 nt5.59□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 SPE3YPR069C 882 nt5.59□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 HIR1YBL008W 2523 nt5.59□□□□□ -1.51
NEJ1Q06148 EHD3YDR036C 1503 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 HSP78YDR258C 2436 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 RAD3YER171W 2337 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 LCL3YGL085W 825 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 LDB7YBL006C 543 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 TSA1YML028W 591 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 RRS1YOR294W 612 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 ATP4YPL078C 735 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 LSG1YGL099W 1923 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 ZWF1YNL241C 1518 nt5.58□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 GPA2YER020W 1350 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 ATP1YBL099W 1638 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 NAS6YGR232W 687 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 MRPS18YNL306W 654 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 SCO2YBR024W 906 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 CWC27YPL064C 906 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YBR124WYBR124W 360 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 STE13YOR219C 2796 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 MKK2YPL140C 1521 nt5.57□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 IRS4YKR019C 1848 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 GPD1YDL022W 1176 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 RAD59YDL059C 717 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 HAP2YGL237C 798 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YJU3YKL094W 942 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YKR045CYKR045C 552 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 IMA2YOL157C 1770 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 VTH1YIL173W 4650 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 VTH2YJL222W 4650 nt5.56□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 SFB3YHR098C 2790 nt5.55□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 TKL1YPR074C 2043 nt5.55□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.55□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 TRP3YKL211C 1455 nt5.55□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 TBF1YPL128C 1689 nt5.55□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YEH1YLL012W 1722 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 CRZ1YNL027W 2037 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 GCG1YER163C 699 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YER186CYER186C 921 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 ECM14YHR132C 1293 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 PFA3YNL326C 1011 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 BIO3YNR058W 1443 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 EPS1YIL005W 2106 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 PLB3YOL011W 2061 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 MCM3YEL032W 2916 nt5.54□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 PYC1YGL062W 3537 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 IDP1YDL066W 1287 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 MRPL35YDR322W 1104 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YEL068CYEL068C 333 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 AAT2YLR027C 1257 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 GLC8YMR311C 690 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 PUS4YNL292W 1212 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 NHA1YLR138W 2958 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YPK2YMR104C 2034 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 FAT3YKL187C 2253 nt5.53□□□□□ -1.52
NEJ1Q06148 YMR279CYMR279C 1623 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 SAL1YNL083W 1485 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 YDL057WYDL057W 987 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 RME1YGR044C 903 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 LDS1YAL018C 978 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 MRP51YPL118W 1035 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 YPR114WYPR114W 948 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 SGF29YCL010C 780 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 ERG8YMR220W 1356 nt5.52□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 ERC1YHR032W 1746 nt5.51□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 UIP5YKR044W 1332 nt5.51□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 JIP4YDR475C 2631 nt5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms