Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 COX16YJL003W 357 nt6.91□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 YJR146WYJR146W 354 nt6.91□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 SRF1YDL133W 1314 nt6.91□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 PEX31YGR004W 1389 nt6.91□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 TEL2YGR099W 2067 nt6.9□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 COX17YLL009C 210 nt6.9□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 YNL108CYNL108C 813 nt6.9□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 YNL194CYNL194C 906 nt6.9□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 UIP5YKR044W 1332 nt6.9□□□□□ -1.3
CEF1Q03654 GIT1YCR098C 1557 nt6.9□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 HEM1YDR232W 1647 nt6.9□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 GPT2YKR067W 2232 nt6.89□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 MSP1YGR028W 1089 nt6.89□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 SRN2YLR119W 642 nt6.89□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YPL136WYPL136W 369 nt6.89□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 OPI11YPR044C 354 nt6.89□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 FET3YMR058W 1911 nt6.89□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 EDE1YBL047C 4146 nt6.88□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 EAF5YEL018W 840 nt6.88□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 ATG36YJL185C 882 nt6.88□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YLR184WYLR184W 348 nt6.88□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YNL228WYNL228W 777 nt6.88□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.88□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 PDB1YBR221C 1101 nt6.88□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 SRG1SRG1 551 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 MDE1YJR024C 735 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YKR032WYKR032W 315 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YML018CYML018C 1182 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YNL120CYNL120C 486 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 TOS6YNL300W 309 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 PTC4YBR125C 1182 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 PTR2YKR093W 1806 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YPR204WYPR204W 3099 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YLL066CYLL066C 3618 nt6.87□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YLL067CYLL067C 3618 nt6.86□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.86□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.86□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YLR463CYLR463C 552 nt6.86□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 GTO3YMR251W 1101 nt6.86□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 ACS1YAL054C 2142 nt6.86□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 ZWF1YNL241C 1518 nt6.86□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 DUG1YFR044C 1446 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 GEX2YKR106W 1848 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 AVO1YOL078W 3531 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 FYV1YDR024W 486 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YDR415CYDR415C 1125 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 IMD1YAR073W 1212 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 ELC1YPL046C 300 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YPL071CYPL071C 471 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 RPL5YPL131W 894 nt6.85□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 RRP9YPR137W 1722 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 TKL1YPR074C 2043 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 EIS1YMR031C 2532 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 SUB2YDL084W 1341 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 SKI2YLR398C 3864 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 YIL077CYIL077C 963 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 TDH2YJR009C 999 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 TAF11YML015C 1041 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 SEC17YBL050W 879 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 RUF23RUF23 254 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 ECM31YBR176W 939 nt6.84□□□□□ -1.31
CEF1Q03654 PTC3YBL056W 1407 nt6.84□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 YPT1YFL038C 621 nt6.83□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 KRE9YJL174W 831 nt6.83□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 PEX32YBR168W 1242 nt6.83□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 LDB16YCL005W 771 nt6.83□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 SKN1YGR143W 2316 nt6.83□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 FAT3YKL187C 2253 nt6.83□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 MSY1YPL097W 1479 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 OPI8YKR035C 642 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 YLR312CYLR312C 1197 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 FPR3YML074C 1236 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 YMR279CYMR279C 1623 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 QRI1YDL103C 1434 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 YPR196WYPR196W 1413 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 SET5YHR207C 1581 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 AVT4YNL101W 2142 nt6.82□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 STE13YOR219C 2796 nt6.81□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 BSC5YNR069C 1470 nt6.81□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 DYS1YHR068W 1164 nt6.81□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 MPC2YHR162W 390 nt6.81□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 FBA1YKL060C 1080 nt6.81□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 OGG1YML060W 1131 nt6.81□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.81□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 KSH1YNL024C-A 219 nt6.81□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 snR82snR82 268 nt6.8□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 SQT1YIR012W 1296 nt6.8□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 VPS24YKL041W 675 nt6.8□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 SCS7YMR272C 1155 nt6.8□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 THI2YBR240C 1353 nt6.8□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 URA7YBL039C 1740 nt6.79□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.79□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 YJR107WYJR107W 987 nt6.79□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 APN1YKL114C 1104 nt6.79□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 MEH1YKR007W 555 nt6.79□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 YNL200CYNL200C 741 nt6.79□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 MRPL10YNL284C 969 nt6.79□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 ARP1YHR129C 1155 nt6.78□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 AIM24YJR080C 1185 nt6.78□□□□□ -1.32
CEF1Q03654 SSK1YLR006C 2139 nt6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 112.3 ms