Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 MRPS5YBR251W 924 nt7.61□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 EHD3YDR036C 1503 nt7.61□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 SES1YDR023W 1389 nt7.6□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 PRI2YKL045W 1587 nt7.6□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 snR82snR82 268 nt7.6□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 EFM1YHL039W 1758 nt7.59□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 COX20YDR231C 618 nt7.59□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 ATO2YNR002C 849 nt7.59□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 SEC23YPR181C 2307 nt7.59□□□□□ -1.19
CTF4Q01454 COR1YBL045C 1374 nt7.59□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 TRR1YDR353W 960 nt7.58□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YEL068CYEL068C 333 nt7.58□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YGL235WYGL235W 537 nt7.58□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 WHI2YOR043W 1461 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 CDC13YDL220C 2775 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YCK1YHR135C 1617 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 BCY1YIL033C 1251 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 COX5AYNL052W 462 nt7.57□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 HST3YOR025W 1344 nt7.56□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 GTT3YEL017W 1014 nt7.56□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 LEU5YHR002W 1074 nt7.56□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 SGE1YPR198W 1632 nt7.56□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YPR114WYPR114W 948 nt7.55□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 NTE1YML059C 5040 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 FET4YMR319C 1659 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YIR042CYIR042C 711 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 MRPS12YNR036C 462 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 AAD15YOL165C 432 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 RPL21AYBR191W 483 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 ATG12YBR217W 561 nt7.54□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 MRK1YDL079C 1506 nt7.53□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.53□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 BSC4YNL269W 396 nt7.53□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YTP1YNL237W 1380 nt7.53□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 RAD24YER173W 1980 nt7.53□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 AFG1YEL052W 1530 nt7.52□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 CDC19YAL038W 1503 nt7.52□□□□□ -1.2
CTF4Q01454 YML133CYML133C 4125 nt7.52□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.52□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 HSP12YFL014W 330 nt7.51□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 RPR2YIR015W 435 nt7.51□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 RPL10YLR075W 666 nt7.51□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 UTP6YDR449C 1323 nt7.51□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 YDL119CYDL119C 924 nt7.5□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 YHM2YMR241W 945 nt7.5□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.5□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 PGM1YKL127W 1713 nt7.49□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 PET20YPL159C 762 nt7.49□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 PUF3YLL013C 2640 nt7.49□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 ATG4YNL223W 1485 nt7.48□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 PHB1YGR132C 864 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 DMA1YHR115C 1251 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 SNO4YMR322C 714 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 UBC11YOR339C 471 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 HSP33YOR391C 714 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 HSP32YPL280W 714 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 GYP8YFL027C 1494 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 RQC1YDR333C 2172 nt7.47□□□□□ -1.21
CTF4Q01454 CBP4YGR174C 513 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 RPE1YJL121C 717 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 SSP120YLR250W 705 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 AIM33YML087C 939 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 ELA1YNL230C 1140 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 DAP1YPL170W 459 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 GLN1YPR035W 1113 nt7.46□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 GUD1YDL238C 1470 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 RHB1YCR027C 630 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 MDH3YDL078C 1032 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 VPS61YDR136C 573 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 COA1YIL157C 594 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 CCP1YKR066C 1086 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 MRPL22YNL177C 930 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 ATP4YPL078C 735 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 CRP1YHR146W 1398 nt7.45□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 RPT3YDR394W 1287 nt7.43□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 YBL070CYBL070C 321 nt7.42□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 ATF1YOR377W 1578 nt7.42□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 MCM3YEL032W 2916 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 MPA43YNL249C 1629 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 SHO1YER118C 1104 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.41□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 KKQ8YKL168C 2175 nt7.4□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 PPS1YBR276C 2424 nt7.4□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 HMS2YJR147W 1077 nt7.4□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 HMT1YBR034C 1047 nt7.4□□□□□ -1.22
CTF4Q01454 IME2YJL106W 1938 nt7.4□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 ACO1YLR304C 2337 nt7.4□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 NSE5YML023C 1671 nt7.39□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 BRL1YHR036W 1416 nt7.39□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 VAR1Q0140 1197 nt7.39□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 RRN10YBL025W 438 nt7.39□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 YFR006WYFR006W 1608 nt7.38□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 TEP1YNL128W 1305 nt7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 93.5 ms