Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME5P56597 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME5P56597 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME5P56597 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME5P56597 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME5P56597 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME5P56597 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NME5P56597 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME5P56597 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME5P56597 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME5P56597 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME5P56597 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME5P56597 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME5P56597 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME5P56597 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME5P56597 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME5P56597 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME5P56597 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME5P56597 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME5P56597 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME5P56597 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME5P56597 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME5P56597 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME5P56597 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME5P56597 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME5P56597 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME5P56597 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME5P56597 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME5P56597 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME5P56597 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME5P56597 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME5P56597 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME5P56597 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME5P56597 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME5P56597 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME5P56597 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME5P56597 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME5P56597 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME5P56597 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME5P56597 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME5P56597 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME5P56597 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME5P56597 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME5P56597 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME5P56597 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME5P56597 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME5P56597 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME5P56597 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME5P56597 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME5P56597 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME5P56597 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME5P56597 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME5P56597 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NME5P56597 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME5P56597 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME5P56597 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME5P56597 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME5P56597 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME5P56597 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME5P56597 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME5P56597 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME5P56597 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME5P56597 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME5P56597 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME5P56597 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms