Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH15P55291 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH15P55291 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH15P55291 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH15P55291 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH15P55291 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH15P55291 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH15P55291 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH15P55291 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH15P55291 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH15P55291 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH15P55291 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH15P55291 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH15P55291 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH15P55291 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH15P55291 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH15P55291 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH15P55291 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH15P55291 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH15P55291 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH15P55291 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH15P55291 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH15P55291 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH15P55291 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH15P55291 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH15P55291 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH15P55291 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH15P55291 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH15P55291 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH15P55291 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH15P55291 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH15P55291 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH15P55291 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH15P55291 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH15P55291 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH15P55291 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH15P55291 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH15P55291 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH15P55291 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH15P55291 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH15P55291 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH15P55291 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH15P55291 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH15P55291 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH15P55291 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH15P55291 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH15P55291 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH15P55291 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH15P55291 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH15P55291 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH15P55291 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH15P55291 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH15P55291 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH15P55291 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH15P55291 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH15P55291 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH15P55291 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH15P55291 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH15P55291 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH15P55291 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH15P55291 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH15P55291 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH15P55291 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH15P55291 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH15P55291 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH15P55291 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH15P55291 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH15P55291 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH15P55291 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH15P55291 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH15P55291 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH15P55291 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms